Varian membimbangkan

Istilah varian membimbangkan (bahasa Inggeris: variant of concern; singkatan: VOC) untuk koronavirus sindrom pernafasan akut teruk 2 (SARS-CoV-2) adalah suatu kategori yang digunakan apabila mutasi-mutasi pada domain ikatan reseptor (receptor binding domain) meningkatkan pertalian ikatan (contohnya N501Y) di kompleks RBD-hACE2 (data genetik), sambil dikaitkan dengan penularan meluas di dalam populasi manusia (data epidemiologi).^[1]

Sebelum ini, varian yang baru muncul mungkin telah dilabelkan sebagai "varian berkepentingan".^[2] Semasa atau selepas penilaian penuh sebagai "varian membimbangkan", varian ini biasanya dikaitkan dengan keturunan dalam sistem tatanama PANGOLIN^[3]^[4] dan pelapis dalam sistem Nextstrain^[5]^[6] dan GISAID.^[7]^[8]

Semasa pandemik COVID-19, virus SARS-CoV-2 telah diperhatikan dapat bermutasi dengan gabungan tertentu beberapa titik mutasi spesifik. Ini membuktikan ianya lebih membimbangkan daripada yang lain.^[9] Hal ini dikatakan demikian kerana penularan dan virulensi serta berkenaan dengan kemungkinan kemunculan "mutasi melarikan diri"^[10] (escape mutations).

Rujukan[sunting | sunting sumber]

^ Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (May 2021). "Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern". Microorganisms (dalam bahasa Inggeris). 9 (5): 926. doi:10.3390/microorganisms9050926. PMC 8146828. PMID 33925854.
^ Ralat petik: Tag <ref> tidak sah; teks bagi rujukan VDoCD tidak disediakan
^ Akronim PANGOLIN merujuk kepada Tugasan Filogenetik Keturunan Wabak Global yang Dinamakan. Sebuah alat perisian dibangunkan oleh ahli-ahli makmal dengan aplikasi web yang berkaitan yang dibangunkan oleh Pusat Pengawasan Patogen Genomik di Cambridgeshire Selatan.
^ Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á.; dll. (2020). "A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology". Nature Microbiology. 5 (11): 1403–1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. PMC 7610519. PMID 32669681. S2CID 220544096.
^ Nextstrain adalah kerjasama antara penyelidik di Seattle, Amerika Syarikat dan Basel, Switzerland yang menyediakan koleksi alat sumber terbuka untuk menggambarkan genetik di sebalik penyebaran wabak virus.
^ Bedford, Trevor; Hodcroft, Emma B; Neher, Richard A (6 January 2021). "Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy". nextstrain.org/blog. Dicapai pada 19 January 2021.
^ GISAID adalah inisiatif sains global dan sumber utama yang ditubuhkan pada tahun 2008. Ia menyediakan akses terbuka kepada data genomik virus influenza dan koronavirus yang bertanggungjawab terhadap pandemik COVID-19.
^ "clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')". www.gisaid.org. 4 July 2020. Dicapai pada 7 January 2021.
^ Ralat petik: Tag <ref> tidak sah; teks bagi rujukan CanSum tidak disediakan
^ E484K dipanggil mutasi melarikan diri kerana ia membantu virus melarikan diri daripada tentera. Dengan mutasi ini, virus boleh melepasi pertahanan imun kita dan membuat kita sakit. Mutasi melarikan diri timbul kerana tekanan diletakkan pada virus untuk terus hidup

[1] Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (May 2021). "Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern". Microorganisms (dalam bahasa Inggeris). 9 (5): 926. doi:10.3390/microorganisms9050926. PMC 8146828. PMID 33925854.

[VDoCD-2] Ralat petik: Tag <ref> tidak sah; teks bagi rujukan VDoCD tidak disediakan

[3] Akronim PANGOLIN merujuk kepada Tugasan Filogenetik Keturunan Wabak Global yang Dinamakan. Sebuah alat perisian dibangunkan oleh ahli-ahli makmal dengan aplikasi web yang berkaitan yang dibangunkan oleh Pusat Pengawasan Patogen Genomik di Cambridgeshire Selatan.

[RambautETAL.-4] Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á.; dll. (2020). "A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology". Nature Microbiology. 5 (11): 1403–1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. PMC 7610519. PMID 32669681. S2CID 220544096.

[5] Nextstrain adalah kerjasama antara penyelidik di Seattle, Amerika Syarikat dan Basel, Switzerland yang menyediakan koleksi alat sumber terbuka untuk menggambarkan genetik di sebalik penyebaran wabak virus.

[nextstrain-amendation-6] Bedford, Trevor; Hodcroft, Emma B; Neher, Richard A (6 January 2021). "Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy". nextstrain.org/blog. Dicapai pada 19 January 2021.

[7] GISAID adalah inisiatif sains global dan sumber utama yang ditubuhkan pada tahun 2008. Ia menyediakan akses terbuka kepada data genomik virus influenza dan koronavirus yang bertanggungjawab terhadap pandemik COVID-19.

[GCTree-8] "clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')". www.gisaid.org. 4 July 2020. Dicapai pada 7 January 2021.

[CanSum-9] Ralat petik: Tag <ref> tidak sah; teks bagi rujukan CanSum tidak disediakan

[10] E484K dipanggil mutasi melarikan diri kerana ia membantu virus melarikan diri daripada tentera. Dengan mutasi ini, virus boleh melepasi pertahanan imun kita dan membuat kita sakit. Mutasi melarikan diri timbul kerana tekanan diletakkan pada virus untuk terus hidup

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]