Pohon kehidupan (biologi)
Pohon kehidupan atau pohon kehidupan sejagat ialah sebuah kiasan, model dan alat penyelidikan yang digunakan untuk menjelaskan evolusi kehidupan dan menghuraikan hubungan antara organisme, baik yang masih hidup dan yang telah mati. Model tersebut digunakan dalam On the Origin of Species (1859) karya Charles Darwin.[2]
Kedekatan semua makhluk dari kelas yang sama kadangkala diwakili oleh pohon besar. Saya percaya perumpamaan ini sebahagian besar berbicara tentang kebenaran
— Charles Darwin[3]
Pohon kehidupan berasal dari abad pertengahan untuk menggambarkan salasilah keluarga. Manakala pohon filogenetik dalam kerangka evolusi berasal dari pertengahan abad kesembilan belas.
Istilah pohon filogenetik untuk hubungan evolusi spesies sepanjang waktu dicipta oleh Ernst Haeckel, yang melangkah lebih jauh dari Darwin dalam mengemukakan sejarah filogenik kehidupan. Dalam penggunaannya pada masa kini, pohon kehidupan bertumpu pada kumpulan himpunan pangkalan data filogenetik yang komprehensif dan berakar pada leluhur universal terakhir yang hidup di bumi. Open Tree of Life, pertama kali diterbitkan September 2015, ialah projek untuk mengumpulkan pangkalan data pohon kehidupan yang dapat diakses oleh orang ramai secara percuma.
Penggunaan di masa kini[sunting | sunting sumber]
Pada tahun 1990, Carl Woese, Otto Kandler dan Mark Wheelis mengusulkan sebuah "pohon kehidupan" yang terdiri dari tiga garis keturunan yang memperkenalkan istilah domain sebagai pengelasan peringkat tertinggi dalam tingkatan taksonomi. Mereka juga menyarankan istilah bakteria, archaea dan eukariot untuk tiga domain berbeza yang sebelumnya archaea dikelompokkan dalam bakteria.[4]
Model pohon masih dianggap sah untuk bentuk kehidupan eukariotik. Pada tahun 2010, penyelidikan ke atas cabang paling awal dari pohon eukariot telah menghasilkan pohon lainnya dengan empat [5] atau dua adikumpulan.[6] Belum ada konsensus atau kesepakatan setakat ini; dalam sebuah rencana ulasan, Roger dan Simpson menyimpulkan bahawa "dengan peralihan perubahan kini dalam pemahaman kita mengenai pohon kehidupan eukariota, kita harus meneruskannya dengan berhati-hati."[7]
Pada tahun 2015, draf pertama Open Tree of Life diterbitkan, yang menghimpunkan maklumat dari hampir 500 pohon kehidupan dari pelbagai kumpulan organisme yang mencakupi 2.3 juta spesies makhluk hidup yang diterbitkan sebelumnya digabungkan ke dalam satu pangkalan data dalam talian, bebas untuk dicapai dan dimuat turun.[8]
Pada tahun 2016, pohon kehidupan baru, yang merangkum evolusi semua bentuk kehidupan yang diketahui, diterbitkan, menggambarkan penemuan genetik terbaru bahawa cabang-cabang tersebut sebahgian besar terdiri dari bakteria. Kajian baru ini menggabungkan lebih dari seribu bakteria dan archaea yang baru ditemui.[9][10]
Nota kaki[sunting | sunting sumber]
- ^ Hug, Laura A.; Baker, Brett J.; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Probst, Alexander J.; Castelle, Cindy J.; Butterfield, Cristina N.; Hernsdorf, Alex W.; Amano, Yuki; Ise, Kotaro; Suzuki, Yohey; Dudek, Natasha; Relman, David A.; Finstad, Kari M.; Amundson, Ronald; Thomas, Brian C.; Banfield, Jillian F. (11 April 2016). "A new view of the tree of life". Nature Microbiology. 1 (5): 16048. doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48. PMID 27572647.
- ^ Mindell, D. P. (3 January 2013). "The Tree of Life: Metaphor, Model, and Heuristic Device". Systematic Biology. 62 (3): 479–489. doi:10.1093/sysbio/sys115. PMID 23291311.
- ^ Darwin, Charles (1859). "Four: Natural Selection; or the Survival of the Fittest". On the origin of species by means of natural selection, or, The preservation of favoured races in the struggle for life (First Edition, First Thousand ed.). London: John Murray. Hal 129. Diambil11 August 2018.
- ^ Woese, Carl R.; Kandler, O; Wheelis, M (1990). "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya". Proc Natl Acad Sci USA. 87 (12): 4576–9. Empty citation (bantuan)
- ^ Burki, Fabien; Shalchian-Tabrizi, Kamran & Pawlowski, Jan (2008), "Phylogenomics reveals a new 'megagroup' including most photosynthetic eukaryotes", Biology Letters, 4 (4): 366–369,
- ^ Kim, E.; Graham, L.E.; Redfield, Rosemary Jeanne (2008), Redfield, Rosemary Jeanne (ed.), "EEF2 analysis challenges the monophyly of Archaeplastida and Chromalveolata", PLOS ONE, 3 (7): e2621.Empty citation (bantuan)
- ^ Roger, A.J. & Simpson, A.G.B. (2009), "Evolution: Revisiting the Root of the Eukaryote Tree", Current Biology, 19 (4): R165–7, Empty citation (bantuan)
- ^ Pennisi, Elizabeth (21 September 2015). "First comprehensive tree of life shows how related you are to millions of species". www.sciencemag.org. Dicapai pada 15 November 2020.
- ^ Carl, Zimmer (11 April 2016). "Scientists Unveil New 'Tree of Life'". www.nytimes.com atau New York Times. Dicapai pada 15 November 2020.
- ^ Taylor, Ashley P. (11 April 2016). "Branching Out: Researchers create a new tree of life, largely comprised of mystery bacteria". www.the-scientist.com atauThe Scientist. diakses 15 November 2020
/1859_Origin_F373_147.jpg){kind=link}
Rujukan[sunting | sunting sumber]
- Darwin, Charles (1859), On the Origin of Species by Means of Natural Selection, or the Preservation of Favoured Races in the Struggle for Life (ed. 1st), London: John Murray, ISBN 978-1-4353-9386-8
- Darwin, Charles (1872), "The Origin of Species by Means of Natural Selection, or the Preservation of Favoured Races in the Struggle for Life", Nature (ed. 6th), London: John Murray, 5 (121): 318–319, Bibcode:1872Natur...5..318B, doi:10.1038/005318a0, ISBN 978-1-4353-9386-8
- Doolittle, W. F.; Bapteste, E. (2007). "Inaugural Article: Pattern pluralism and the Tree of Life hypothesis". Proceedings of the National Academy of Sciences. 104 (7): 2043–2049. Bibcode:2007PNAS..104.2043D. doi:10.1073/pnas.0610699104. PMC 1892968. PMID 17261804.
Pautan luar[sunting | sunting sumber]
- Tree of Life Web Project - explore complete phylogenetic tree interactively
- Tree of Life Evolution Links species on Earth through a shared evolutionary history
- Science journal issue - Issue devoted to the tree of life.
- The Tree of Life by Garrett Neske, The Wolfram Demonstrations Project: "presents an interactive tree of life that allows you to explore the relationships between many different kinds of organisms by allowing you to select an organism and visualize the clade to which it belongs."
- The Green Tree of Life - Hyperbolic tree University of California/Jepson Herbaria
- NCBI's taxonomy database common tree