Escherichia coli

Daripada Wikipedia, ensiklopedia bebas.
Lompat ke: pandu arah, cari
Escherichia coli
Pengelasan saintifik
Domain: Bakteria
Filum: Proteobacteria
Kelas: Gammaproteobacteria
Order: Enterobacteriales
Keluarga: Enterobacteriaceae
Genus: Escherichia
Spesies: E. coli
Nama binomial
Escherichia coli
(Migula 1895)
Castellani dan Chalmers 1919
Sinonim

Bacillus coli communis Escherich 1885

Escherichia coli (biasanya diringkaskan kepada E. coli; disebut / ˌpron.: /ˌɛʃəˈrɪkiə ˈkl/ /, dinamakan bersempena dengan Theodor Escherich) adalah bakteria gram negatif berbentuk batang/basilus/rod yang umum ditemui di usus bawah organisma berdarah panas (endotermik). Kebanyakan strain E. coli tidak berbahaya, tetapi terdapat beberapa jenis/strain, seperti serotip O157: H7, boleh menyebabkan keracunan makanan yang serius pada manusia, dan kadang-kala ini menyebabkan produk makanan dipanggil balik.[1][2] Strain tidak berbahaya ini sebenarnya adalah sebahagian daripada unsur alam flora usus yang normal bersama dengan jenis bilion strain yang jahat dan baik yang lain. Strain ini juga boleh menguntungkan perumah mereka dengan menghasilkan vitamin K2,[3], dan dengan mencegah pembentukan bakteria patogen dalam usus.[4][5]

E. coli tidak hanya terbatas untuk hidup di usus sahaja, strain ini juga berkemampuan untuk bertahan hidup bagi jangka masa yang singkat di luar tubuh lantas membuatkan mereka suatu jenis organisma penunjuk yang ideal untuk menguji sampel persekitaran bagi pencemaran najis seperti tahi.[6][7] Bakteria ini juga boleh berkembang biak dengan mudah, dan genetiknya mudah untuk dimanipulasikan atau digandakan melalui proses metagenik, menjadikannya salah satu daripada model organisma terbaik prokariotik untuk didalami dan dipelajari, dan merupakan spesies penting dalam bidang kajian bioteknologi dan mikrobiologi.

E. coli ditemui oleh seorang doktor watan Jerman dan ahli bakteriologi iaitu Theodor Escherich pada tahun 1885[6] and is now classified as part of the Enterobacteriaceae family of gamma-proteobacteria.[8] , dan sekarang strain ini diklasifikasikan sebagai sebahagian daripada Enterobacteriaceae dalam keluarga gamma-proteobakteria.[9]

Strain[sunting | sunting sumber]

Model fizik binari berturutan dalam E. coli[sunting | sunting sumber]

Setiap satu strain E. coli merupakan sub-kumpulan dalam spesies yang mempunyai ciri-ciri unik yang membezakannya dari strain E. coli yang lain. Perbezaan ini sering dikesan hanya pada peringkat molekul, namun mereka boleh menyebabkan perubahan fisiologi atau kitaran hidup bakteria. Misalnya, strain mungkin mendapatkan kapasiti patogen, kemampuan untuk menggunakan sumber karbon yang unik, kemampuan untuk mengambil bagi niche ekologi tertentu atau kemampuan untuk melawan agen antimikrob. Berbagai strain E. coli sering khusus-hos, sehingga memungkinkan untuk menentukan sumber pencemaran najis dalam sampel persekitaran Sebagai contoh., Mengetahui jenis E. coli strain yang hadir dalam sampel air membolehkan untuk membuat andaian tentang apakah pencemaran berasal dari manusia, mamalia lain atau burung.

Strain baru E. coli berkembang melalui proses biologi alami mutasi dan melalui pemindahan gen hos mendatar. Beberapa strain mengembangkan ciri-ciri yang dapat berbahaya bagi haiwan hos. Strain merbahaya ini biasanya menyebabkan serangan cirit-birit yang tidak menyenangkan pada orang dewasa yang sihat dan sering membawa maut kepada anak-anak di negara-negara membangun. Lebih virulen strain, seperti O157:. H7 menyebabkan penyakit serius atau kematian pada orang tua, sangat muda atau immunocompromised.

Biologi dan biokimia[sunting | sunting sumber]

Model kejayaan proses belahan dedua di dalam bakteria E. coli

E. coli adalah Gram-negatif, fakultatif anaerob dan bukan bersporulasi. Sel biasanya berbentuk batang dan sekitar 2 mikrometer (pM) 0,5 pM panjang dan diameter, dengan kelantangan sel 0,6-0,7 (μm)3.[10][11] Hal ini dapat hidup pada berbagai macam substrat. E. coli fermentasi menggunakan campuran asid dalam keadaan anaerobik, menghasilkan laktat, suksinat, etanol, asetik dan karbon dioksida. Karena banyak pusat fermentasi asam campuran menghasilkan gas hidrogen, pusat ini memerlukan tahap hidrogen menjadi rendah, seperti halnya ketika E. coli tinggal bersama-sama dengan hidrogen memakan organisma seperti bakteria-methanogen atau mengurangkan sulfat.[12]

Pertumbuhan optimum E. coli terjadi pada 37 ° C (98,6 ° F) tetapi beberapa strain makmal dapat berkembang biak pada suhu sehingga 49 ° C (120.2 ° F).[13] Pertumbuhan dapat digerakkan oleh respirasi aerobik atau anaerobik,. menggunakan berbagai macam pasangan redoks, termasuk pengoksidaan asid piruvat, asam format, hidrogen dan asid amino, dan pengurangan substrat seperti oksigen, nitrat, sulfoxide dimetil dan trimetilamina N-oksida. [14]

Strain yang mengandungi flagela boleh berenang dan bergerak. flagela mempunyai susunan peritrichous. [15]

E. coli dan bakteria yang berkaitan mempunyai kemampuan untuk memindahkan DNA melalui bakteria, transduksi konjugasi atau transformasi, yang membolehkan bahan genetik untuk menyebar secara melintang melalui penduduk yang ada. Proses ini menyebabkan penyebaran gen penyandi toksin Shiga dari Shigella untuk E. coli O157:., H7 dibawa oleh suatu bakteriofag.[16]

Kepelbagaian[sunting | sunting sumber]

Filogeni strain-strain Escherichia coli

E. albertii




E. fergusonii







E. coli O157:H7



Shigella flexineri





Shigella dysenteriae






E. coli E24377A



Shigella boydii







Shigella sonnei




E. coli E110019




E. coli O26:H11



E. coli O111:H-







E. coli SE11



E. coli B7A







E. coli O103:H2



E. coli E22





E. coli Olso O103



E. coli 55989








E. coli IAI1




E. coli 53638



E. coli HS








E. coli UMN026







E. coli SMS-3-5



E. coli IAI39






E. coli SE15



E. coli O127:H6





E. coli ED1a





E. coli CFT073




E. coli APEC O1



E. coli UTI89



E. coli S88






E. coli F11



E. coli 536










E. coli BW2952


K-12

E. coli K-12 W3110



E. coli K-12 DH10b



E. coli K-12 DH1



E. coli K-12 MG1655




B

E. coli 101-1



E. coli B REL606



E. coli BL21-DE3







Filogeni (ditaabir sejarah evolusi) bagi Escherichia coli berdasarkan kepada sekumpulan gen-gen dipulihara (adk, fumC, icd, gyrB, mdh, purA, recA)[17]

Oleh kerana lebih banyak diketahui mengenai organisme-organisme tertentu, seperti maklumat genetik, pengkelasan taksonomi bagi spesies diubah untuk mencerminkan kemajuan di dalam pengetahuan berkenaan, walau bagaimanapun di dalam kes Escherichia coli disebabkan oleh kepentingan perubatan, ianya tidak berlaku (namanya dipecah-pecahkan ke dalam beberapa genus/spesies)[18] dan masih lagi menjadi salah satu daripada spesies bacteria yang paling pelbagai: hanya 20% daripada genom adalah biasa bagi semua strain.[17] Memang benar, daripada pandangan kajian evolusi, ahli-ahli genus Shigella (dysenteriae, flexneri, boydii, sonnei) are actually E. coli strains "in disguise" (i.e. E.coli is paraphyletic to the genus).[19]

Suatu strain bagi E. coli adalah suatu sub-kumpulan di dalam spesies ini yan mempunyai ciri-ciri unik yang memisahkannya daripada strain-strain E. coli yang lain . Perbezaan ini selalunya dikesan hanya pada aras molekul; bagaimanapun, mereka mungkin menyebabkan perubahan kepada fisiologi atau kitaran hidup bakteria itu. Sebagai contoh, satu strain mungkin menambah keupayaan berpatogen, kebolehan menggunakan satu sumber karbon yang unik, kebolehan untuk bertindak sendiri terhadap nic ekologi tertentu atau berkebolehan untuk menentang agen-agen antimikrob. Perbezaan strain-strain E. coli adalah selalunya perumah khusus, membolehkannya ia menilai sumber pencemaran najis di dalam sampel-sampel alam sekitar.[6][7] Sebagai contoh, mengetahi yang mana jenis E. coli yang wujud di dalam sampel air membolehkan penyelidik-penyelidik membuat andaian samada pencemaran ini berasal daripada manusia, in a water sample allows researchers to make assumptions about whether the contamination originated from a human, seekor mamalia lain atau seekor burung.


Satu sistem subdivisyen E.coli, tetapi tidak berdasarkan kepada kaitan evolusi, tetapi oleh serotip, yang mana ia berdasarkan kepada permukaan antigen-antigen utama (O antigen: sebahagian daripada permukaan lipopolysaccharide; H: flagellin; antigen K : kapsul), e.g. O157:H7)[20] (NB: K-12, strain makmal yang biasa bukan suatu serotip.)

Strainstrain baru bagi E. coli berubah menerusi proses mutasi biologi semulajadi dan menerusi pemindahan gen mendatar.[21] Beberapa strain menghasilkan trait yang merbahaya kepada perumah haiwan. Strain-strain yang jenis virulen menyebabkan diarrhoea yang tidak selesa kepada orang dewasa yang sihat dan biasanya membawa maut kepada kanak-kanak di dalam negara-negara membangun.[22] Lebih banyak strain-strain yang virulen, seperti O157:H7 yang menyebabkan penyakit yang serius atau kematian bagi orang-orang tua, orang-orang muda atau bai yang terimunokompromi.[4][22]


E. coli adalah jenis spesies bagi genus dan strain neotip adalah ATCC 11775, juga dikenali sebagai NCTC 9001,[23] yang patogenik kepada ayam-ayam dan mempunyai serotip O1:K1:H7.[24] Walau bagaimanapun, di dalam kebanyakan kajian samada O157:H7 atau K-12 MG1655 atau K-12 W3110 digunakan sebagai wakil kepada E.coli.

Peranan sebagai mikrobiota normal[sunting | sunting sumber]

E. coli biasanya mengkoloni saluran pencernaan bayi dalam masa 40 jam selepas lahir, tiba dengan makanan atau air atau dengan individu pengendalian anak. Dalam usus, ia melekat pada lendir/mukus dari usus besar. Ini adalah anaerob fakultatif utama dari saluran pencernaan manusia. (fakultatif anaerob adalah organisma yang dapat membiak di dalam oksigen samada wujud atau tidak.) Selama mana bakteria ini memperolehi pengekodan unsur-unsur genetik untuk faktor-faktor virulen, mereka tetap komensal yang jinak.

Penggunaan terapeutik bagi E. coli yang bukan patogen[sunting | sunting sumber]

Strain Escherichia coli Nissle 1917 yang bukan patogen juga dikenali sebagai Mutaflor digunakan sebagai agen probiotik dalam rawatan, terutama untuk rawatan pelbagai penyakit gastroenterological, termasuk penyakit usus inflamatori.

Peranan dalam penyakit[sunting | sunting sumber]

Strain E. coli yang virulen boleh menyebabkan gastroenteritis, jangkitan saluran kencing, dan meningitis neonatal. Dalam kes-kes yang jarang, strain ganas juga bertanggungjawab untuk sindrom hemolitik-uremik, peritonitis, mastitis, septicemia, pneumonia gram-negatif.

Jangkitan gastrousus[sunting | sunting sumber]

Mikrograf elektron bersuhu rendah bagi segugus bakteria E. coli, diperbesarkan 10,000 kali. Setiap individu bakterium adalah bersilinder bulat.

Strain tertentu dari E. coli, seperti O157: H7, O121 dan O104: H21, menghasilkan racun yang membunuh. Keracunan makanan yang disebabkan oleh E. coli biasanya disebabkan oleh pemakanan sayuran yang tidak dibasuh atau daging kurang dimasak. O157: H7 juga terkenal menyebabkan komplikasi pembunuh jiwa yang serius, bahkan seperti sindrom hemolitik-uremik. Strain tertentu ini adalah berkaitan dengan wabak 2006 Amerika Syarikat E. coli disebabkan oleh bayam segar. Keterukan penyakit ini adalah perlbagai, boleh membunuh, terutama bagi kanak-kanak, orang tua atau yang berimunokompromi, tetapi lebih ringan. Sebelumnya, kaedah-kaedah menyediakan daging yang lemah di Scotland membunuh tujuh orang pada tahun 1996 akibat keracunan E. coli, dan menyebabkan beratus-ratus orang lebih dijangkiti. E. coli boleh melabuhkan enterotoksin tahan panas dan labil haba. Yang kedua, disebut sebagai LT, mengandungi satu subunit A dan lima subunit B yang disusun menjadi satu holotoksin, dan sangat mirip pada struktur dan fungsi untuk racun kolera/taun. Subunit B membantu dalam melekat dan memasukkan racun ke dalam sel-sel usus perumah, sedangkan subunit A ini melekat dan menghalang sel-sel daripada menyerap air, menyebabkan cirit-birit. LT ini dirembeskan oleh rembesan jenis laluan pusat 2.

Jika E. coli bakteria melepaskan diri dari saluran usus melalui penembusan (misalnya dari ulser, usus apendiks yang pecah, atau kerana kesilapan pembedahan) dan memasuki abdomen, mereka biasanya menyebabkan peritonitis yang mengakibatkan kematian sekiranya tidak mendapat rawatan segera. Namun, E. coli sangat peka terhadap antibiotik seperti streptomisin atau gentamisin. Hal ini boleh berubah kerana, sebagaimana dinyatakan di bawah, E. coli cepat mangli kepada ubat-ubat antibiotik. Penyelidikan terkini menunjukkan bahawa rawatan dengan antibiotik tidak mengurangkan penyakit, dan ini mungkin sebenarnya secara signifikan meningkatkan kemungkinan mengembangkan sindrom hemolitik-uremik.

Mukus usus berkaitan E. coli yang diperhatikan bertambah di dalam jumlah pada penyakit radang usus, penyakit Crohn dan kolitis ulser.Strain E. coli yang invasif wujud di dalam jumlah yang tinggi pada tisu-tisu keradangan, dan jumlah bakteria di dalam kawasan keradangan berkait rapat dengan peningkatan keterukan keradangan usus.

Sifat-sifat virulen[sunting | sunting sumber]

E. coli (EC)yang enterik dikelaskan berdasarkan asas-asas serologi dan sifat virulen.[25] Virotip-virotip termasuklah:

Nama Perumah Perincian
Enterotoksigenik E. coli (ETEC) agen penyebab diare/taun (tanpa demam) pada manusia, babi, domba, kambing, lembu, anjing, dan kuda ETEC menggunakan adhesin fimbrium (unjuran dari permukaan sel bakteria) untuk mengikat sel-sel enterosit di dalam usus kecil. ETEC boleh menghasilkan dua protein enterotoksin:


  • Di antara dua protein yang lebih besar, Enterotoksin LT, adalah serupa dengan toksin kolera dalam struktur dan fungsi.
  • Protein yang lebih kecil, Enterotoksin ST menyebabkan pengumpulan cGMP di dalam sel-sel sasaran dan perembesan seterusnya cairan dan elektrolit ke dalam lumen usus.

Strain ETEC adalah bukan jenis invasif, dan mereka tidak meninggalkan lumen usus. ETEC adalah bakteria penyebab utama diare pada anak-anak di negara-negara membangun, dan juga sebagai penyebab paling umum bagi taun. Setiap tahun, ETEC menyebabkan lebih dari 200 juta kes cirit-birit dan 380.000 kematian, terutama pada anak-anak di negara-negara membangun.[26]

Enteropathogenic E. coli (EPEC) agen penyebab diare pada manusia, kelinci, anjing, kucing dan kuda Seperti ETEC, EPEC juga menyebabkan diare, tetapi mekanisme molekul penjajahan dan etiologi yang berbeza. EPEC mempunyai kurang fimbriae, racun ST dan LT, tetapi mereka menggunakan sebuah adhesin dikenali sebagai intimin untuk mengikat sel-sel usus perumah. Virotip ini mempunyai pelbagai faktor virulen yang mirip kepada yang ditemui di dalam Shigella, dan mungkin mempunyai toksin Shiga.Pelekatan pada mukus usus menyebabkan penyusunan semula aktin di dalam sel perumah, menyebabkan kecacatan yang signifikan. Sel-sel EPEC ini agak invasif (iaitu mereka memasuki sel perumah) dan menimbulkan gerakbalas keradangan.Perubahan dalam sel usus ultrastruktur kerana "lampiran dan penghapusan" kemungkinan penyebab utama diare pada mereka yang menderita dengan EPEC.


Enteroinvasive E. coli (EIEC) hanya ditemui pada manusia Jangkitan EIEC menyebabkan sindrom yang sama dengan Shigellosis, dengan ceret-beret yang banyak dan demam panas.
Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) ditemui pada manusia, lembu, dan kambing Ahli paling terkenal di dalam virotip ini adalah strain O157:H7, yang menyebabkan diare berdarah dan tiada demam .EHEC boleh menyebabkan sindrom hemolitik-uremik dan kegagalan ginjal berfungsi serta merta. Ia menggunakan fimbrium bakteria untuk perlekatan (E. coli common pilus, ECP),[27] adalah agak invasif mempunyai racun Shiga difajkodkan yang dapat mencungkil satu gerakbalas keradangan yang menakutkan.
Enteroaggregative E. coli (EAEC) hanya ditemui pada manusia Dinamakan sedemikian kerana mereka mempunyai fimbrium yang mengumpulkan sel-sel kultur tisu, mengikat EAEC pada rembesan usus menyebabkan taun berair tanpa demam. EAEC adalah bukan jenis invasif. Mereka menghasilkan suatu hemolisin dan enterotoksin ST serupa dengan ETEC.

Epidemiologi jangkitan pencernaan[sunting | sunting sumber]

Penularan patogen E. coli sering terjadi melalui penghantaran faecal-oral [19] [29] [30] laluan umum penularan meliputi:. Persiapan makanan tidak higienis, [29] pencemaran pertanian kerana baja pemupukan, [31] pengairan tanaman dengan tercemar greywater atau sisa mentah, [32] babi liar di ladang, [33] atau pengambilan langsung sisa-air yang tercemar [34] perah dan sapi potong adalah reservoir utama E. coli O157:. H7, [35] dan mereka boleh membawanya asymptomatically dan menumpahkan dalam kotoran mereka. [35] produk makanan yang berkaitan dengan wabak E. coli termasuk daging lembu mentah, [36] kecambah biji mentah atau bayam, [31] susu mentah, jus yang tidak dipasteurisasi, keju tidak dipasteurisasi dan makanan yang tercemar oleh dijangkiti makanan pekerja melalui laluan fekal-oral. [29]

Menurut US Food and Drug Administration, kitaran fekal-oral penghantaran boleh terganggu dengan memasak makanan dengan baik, mencegah pencemaran silang, melembagakan halangan seperti sarung tangan untuk pekerja makanan, melembagakan dasar penjagaan kesihatan sehingga makanan pekerja industri mencari rawatan ketika mereka sakit, pasteurisasi produk jus atau susu dan keperluan cuci tangan yang benar. [29]

Shiga racun-menghasilkan E. coli (STEC), khususnya serotype O157: H7, juga telah disebarkan oleh lalat, [37] [38] [39] dan juga sebagai kenalan langsung dengan haiwan ternakan, [40] [41] kebun binatang haiwan, [42] dan zarah udara yang ditemui di persekitaran haiwan-penyelenggaraan. [43]

Jangkitan saluran kencing[sunting | sunting sumber]

Bakteria E. coli , flora gram-negatif yang paling prevalen di dalam usus.[28]

Uropathogenic E. coli (UPEC) bertanggung jawab untuk sekitar 90% dari jangkitan saluran kencing (ISK) terlihat pada individu dengan anatomi biasa. [25] In ascending infections, fecal bacteria colonize the urethra and spread up the urinary tract to the bladder as well as to the kidneys (causing pyelonephritis),[29] Pada jangkitan naik,. Bakteria fecal menjajah uretra dan menyebar sampai saluran kencing ke pundi kencing juga sebagai kepada buah pinggang (menyebabkan pielonefritis), [45] atau prostat pada laki-laki. Kerana perempuan mempunyai uretra lebih pendek daripada lelaki, mereka adalah 14 kali lebih mungkin untuk menderita daripada ISK menaik. [18]

Uropathogenic E. coli menggunakan fimbriae P (pili pielonefritis-persatuan) pada sel-sel saluran kencing endotel mengikat dan menjajah kandung kemih. Ini adhesins kumpulan mengikat khusus D-galaktosa-D-galaktosa pada antigen darah-kumpulan P eritrosit dan sel uroepithelial. [18] Kira-kira 1% daripada penduduk manusia tidak memiliki reseptor ini, dan kehadiran atau tidak adanya menentukan kerentanan individu untuk E coli jangkitan. saluran kemih. Uropathogenic E. coli menghasilkan alpha-dan beta-hemolysins, yang menyebabkan kematian sel saluran kencing.

UPEC boleh mengelakkan pertahanan bawaan kekebalan tubuh (contohnya komplemen sistem) dengan menyerang sel-sel payung dangkal untuk membentuk komuniti bakteria intraseluler (IBCs). [46] Mereka juga mempunyai kemampuan untuk membentuk antigen K, polisakarida kapsul yang menyumbang terhadap pembentukan biofilm. Biofilm-menghasilkan E. coli yang bandel dengan faktor kekebalan tubuh dan terapi antibiotik dan sering bertanggung jawab untuk kronik jangkitan saluran kencing [47] K-menghasilkan antigen E. coli jangkitan. Biasanya ditemui di saluran kemih atas. [18]

Penurunan jangkitan, meskipun relatif jarang terjadi, terjadi ketika sel E. coli masuk ke organ saluran kencing atas (ginjal, pundi kencing atau ureter) dari aliran darah. [Sunting] meningitis neonatal

Hal ini dihasilkan oleh serotype Escherichia coli yang mengandungi antigen kapsul disebut K1. Penjajahan usus bayi yang baru lahir dengan batang tersebut, yang hadir dalam faraj ibu, menyebabkan bakteremia, yang mengarah ke meningitis. Dan kerana tidak adanya antibodi IgM dari ibu (ini tidak melewati plasenta kerana hanya FcRn menengahi pemindahan IgG), ditambah fakta bahawa tubuh mengakui sebagai diri antigen K1, kerana menyerupai glicopeptides otak, ini mengarah ke meningitis teruk pada neonatus.

Diagnosis makmal[sunting | sunting sumber]

Dalam sampel tahi mikroskop akan menunjukkan batang Gram negatif, tanpa tatacara sel tertentu. Kemudian, baik MacConkey Agar atau agar-agar EMB (atau kedua-duanya) yang diinokulasi dengan bangku. Pada MacConkey agar-agar, tanah jajahan merah tua dihasilkan sebagai organisma adalah laktosa-positif, dan fermentasi gula ini akan menyebabkan pH medium turun, menyebabkan penggelapan dari media. Pertumbuhan pada to EMB Levine menghasilkan koloni hitam dengan kilau metalik kehijauan-hitam. Ini adalah diagnostik E. coli. Organisma ini juga lisin positif, dan tumbuh di cerun TSI dengan (A / A / g + / H2S-) profil. Juga, IMViC adalah {+ + - -} untuk E. coli, seperti itu indole-positif (cincin merah) dan metil merah-positif (merah cerah), tetapi VP-negatif (tidak ada-perubahan tidak berwarna) dan sitrat-negatif (tidak ada perubahan-warna hijau). Ujian untuk pengeluaran racun boleh menggunakan sel-sel mamalia dalam kultur jaringan, yang dengan cepat dibunuh oleh toksin Shiga. Walaupun sensitif dan sangat khusus, kaedah ini lambat dan mahal. [48]

Biasanya diagnosis telah dilakukan oleh kultur pada sorbitol-MacConkey menengah dan kemudian menggunakan antiserum menaip. Namun, ujian lateks saat ini dan beberapa antiserum menaip menunjukkan reaksi silang dengan non-E. coli O157 tanah jajahan. Selain itu, tidak semua jenis E. coli O157 berkaitan dengan HUS adalah fermentor nonsorbitol.

Dewan Negara dan Epidemiologi Wilayah mengesyorkan bahawa paparan makmal klinikal paling tidak semua tahi berdarah untuk patogen ini. The American Association Gastroenterological Foundation (AGAF) yang disarankan pada bulan Julai 1994 bahawa semua spesimen tahi harus secara rutin diuji untuk E. coli O157:. H7 [rujukan?] Disarankan bahawa cek doktor dengan jabatan kesihatan negara mereka atau Centers for Disease Control dan Pencegahan untuk menentukan spesimen perlu diuji dan apakah hasilnya dilaporkan.

Kaedah lain untuk mengesan E. coli O157 dalam tahi meliputi ujian ELISA, immunoblots tanah jajahan, mikroskop immunofluorescence langsung penapis, serta immunocapture teknik menggunakan manik-manik magnet. [49] ujian ini direka sebagai alat skrining untuk membolehkan ujian cepat untuk kehadiran E. coli O157 tanpa terlebih dahulu kultur dari spesimen tahi. [Sunting] terapi antibiotik dan pertahanan Rencana utama: pertahanan antibiotik

Jangkitan bakteria biasanya dirawat dengan antibiotik. Namun, sensitiviti antibiotik dari strain yang berbeza E. coli sangat bervariasi. Sebagai organisma Gram-negatif, E. coli yang dapat bertahan terhadap banyak antibiotik yang berkesan terhadap organisma Gram-positif. Antibiotik yang boleh digunakan untuk mengubati jangkitan E. coli termasuk amoksisilin serta penisilin semi-sintetik yang lain, banyak sefalosporin, carbapenems, aztreonam, trimetoprim-sulfametoksazol, Ciprofloxacin, nitrofurantoin dan aminoglikosida.

pertahanan antibiotik merupakan masalah yang berkembang. Beberapa hal ini kerana terlalu banyak digunakan antibiotik pada manusia, tetapi beberapa dari itu mungkin disebabkan oleh penggunaan antibiotik sebagai promotor pertumbuhan dalam makanan haiwan [50] Penyelidikan yang diterbitkan dalam jurnal Science pada Ogos 2007 ditemui. Bahawa tingkat mutasi adaptif pada E. coli adalah "pada urutan 10-5 pada genome pada generasi, yang 1,000 kali lebih tinggi daripada anggaran sebelum ini," sebuah penemuan yang mungkin mempunyai arti penting bagi kajian dan pengurusan pertahanan antibiotik bakteria. [51]

Antibiotik-tahan E. coli juga boleh meneruskan gen yang bertanggung jawab untuk pertahanan antibiotik dengan spesies lain bakteria, seperti Staphylococcus aureus, melalui proses yang disebut pemindahan gen horizontal. E. coli sering membawa multidrug plasmid tahan dan di bawah tekanan mudah dengan alihan tersebut plasmid dengan spesies lain. Memang, E. coli adalah ahli sering biofilm di mana banyak spesies bakteria yang ada di dekat satu sama lain. Campuran ini spesies membolehkan E. coli strain yang piliated untuk menerima dan pemindahan plasmid dari dan ke bakteria yang lain. Jadi E. coli dan enterobacteria lain waduk penting pertahanan antibiotik dipindahmilik. [52]

Strain Beta-laktamase[sunting | sunting sumber]

Pertahanan terhadap antibiotik beta-laktam telah menjadi masalah tertentu dalam beberapa dekad terakhir, sebagai strain bakteria yang menghasilkan diperpanjang-spektrum beta-laktamase telah menjadi lebih umum. [53] Enzim-enzim beta-laktamase membuat banyak, jika tidak semua, dari penisilin dan sefalosporin tidak berkesan sebagai terapi. Extended-spektrum beta-laktamase E. coli sangat resisten terhadap pelbagai antibiotik dan jangkitan oleh strain yang sukar untuk mengubati. Dalam banyak kes, hanya dua antibiotik oral dan kumpulan yang sangat terhad antibiotik intravena tetap berlaku. Pada tahun 2009, gen yang disebut New Delhi Metallo-beta-laktamase (disingkat NDM-1) yang bahkan memberikan perlawanan terhadap carbapenem antibiotik intravena, ditemui di India dan Pakistan pada bakteria E. coli.

Peningkatan keprihatinan tentang tersebar luasnya dari bentuk "super" di Inggeris telah menyebabkan panggilan untuk pemantauan lebih lanjut dan strategi Inggeris-luas untuk menangani jangkitan dan kematian. [54] Kerentanan ujian harus Manual perubatan di semua jangkitan yang organisma dapat diisolasi untuk budaya.

Terapi fag[sunting | sunting sumber]

Fag terapi-virus yang secara khusus menargetkan patogen-bakteria telah dibangunkan selama 80 tahun terakhir, terutama di Kesatuan Soviet, di mana ia digunakan untuk mengelakkan diare yang disebabkan oleh E. coli [55] Saat ini,. Fag terapi untuk manusia sedia . hanya di fag Therapy Center di Republik Georgia dan di Poland [56] Namun, pada tarikh 2 Januari 2007, FDA Amerika Syarikat memberikan persetujuan Omnilytics untuk melaksanakan nya E. coli O157: H7 membunuh fag di sembur, kabut atau cuci pada haiwan hidup yang akan dipotong untuk dimakan manusia [57] The bakteriofag T4. adalah fag yang sangat mempelajari bahawa target untuk jangkitan E. coli.

Vaksinasi[sunting | sunting sumber]

Para penyelidik telah aktif bekerja untuk mengembangkan keselamatan, vaksin yang efektif untuk menurunkan kejadian di seluruh dunia jangkitan E. coli [58] Pada bulan Mac 2006, vaksin mencetuskan respon kekebalan tubuh terhadap E. coli O157:. H7 O-khusus polisakarida terkonjugasi untuk rekombinan eksotoksin A Pseudomonas aeruginosa (O157-RepÃ) dilaporkan selamat pada anak 2-5 tahun. Penelitian sebelumnya telah menunjukkan bahawa sudah selamat untuk orang dewasa [59] Sebuah fasa III uji klinis untuk membuktikan keampuhan skala besar dari rawatan ini adalah. Dirancang. [59]

Pada tahun 2006 Fort Dodge Kesihatan Haiwan (Wyeth) memperkenalkan vaksin dilemahkan yang berkesan untuk mengendalikan airsacculitis hidup dan peritonitis pada ayam. Vaksin ini adalah vaksin avirulen kejuruteraan genetik yang telah menunjukkan perlindungan terhadap O78 dan strain untypeable. [60]

Pada bulan Januari 2007, syarikat bio-farmasi Kanada Bioniche mengumumkan bahawa ia telah membangunkan sebuah vaksin ternakan yang mengurangkan jumlah O157:. H7 tertumpah dalam pupuk kandang dengan faktor 1000, untuk sekitar 1000 bakteria patogen pada gram baja [61] [62] [63]

Pada bulan April 2009, Michigan State University penyelidik mengumumkan bahawa ia telah membangunkan vaksin bekerja untuk strain E. coli. Saeed Mahdi, profesor epidemiologi dan penyakit berjangkit di perguruan tinggi MSU's Perubatan Haiwan dan Manusia Perubatan, telah mengajukan permohonan paten untuk penemuan dan telah melakukan hubungan dengan syarikat farmasi untuk pengeluaran komersial. [64]

Peranan dalam bioteknologi[sunting | sunting sumber]

Kerana sejarah panjang budaya makmal dan kemudahan manipulasi, E. coli juga memainkan peranan penting dalam kejuruteraan biologi moden dan mikrobiologi industri. [65] Karya Norman Stanley Cohen dan Herbert Boyer dalam E. coli, plasmid menggunakan dan sekatan enzim untuk membuat DNA rekombinan, menjadi asas dari bioteknologi. [66]

Dianggap sebagai tuan rumah sangat serbaguna untuk pengeluaran protein heterolog, [67] penyelidik dapat memperkenalkan gen ke dalam mikrob menggunakan plasmid, sehingga memungkinkan untuk pengeluaran massa protein dalam proses fermentasi industri. sistem genetik juga telah dibangunkan yang membolehkan pengeluaran protein rekombinan menggunakan E. coli. Salah satu aplikasi yang berguna pertama dari teknologi DNA rekombinan adalah manipulasi E. coli untuk menghasilkan insulin manusia [68] Modified E. coli telah digunakan dalam pembangunan vaksin, bioremediasi, dan pengeluaran enzim amobil. [67] E. coli. tidak boleh, bagaimanapun, akan digunakan untuk menghasilkan beberapa, protein lebih besar kompleks yang mengandungi ikatan disulfida ganda dan, khususnya, tiol tidak berpasangan, atau protein yang juga memerlukan pengubahsuaian pasca-translasi untuk aktiviti. [65]

Kajian juga sedang dilakukan ke dalam program E. coli berpotensi menyelesaikan masalah matematik yang rumit seperti masalah jalan Hamiltonian. [69]

Kualiti persekitaran[sunting | sunting sumber]

E. coli bakteria telah sering ditemui di perairan rekreasi dan kehadiran mereka digunakan untuk menunjukkan adanya pencemaran feses baru-baru ini, tetapi E. coli kehadiran mungkin tidak menunjukkan kotoran manusia. E. coli yang berlabuh di semua haiwan berdarah panas: burung dan mamalia sama. bakteria E. coli juga telah dijumpai pada ikan dan penyu. Pasir dan tanah juga pelabuhan E. coli bakteria dan beberapa strain dari E. coli telah menjadi dinaturalisasi. Beberapa daerah geografi yang boleh menyokong penduduk yang unik dari E. coli dan sebaliknya, beberapa E. coli strain kosmopolitan [2]. [Sunting] Model organisma

E. coli sering digunakan sebagai model organisma dalam kajian mikrobiologi. strain Budidaya (contohnya E. coli K12) adalah menyesuaikan diri dengan baik dengan persekitaran makmal, dan, tidak seperti strain jenis liar, telah kehilangan kemampuan mereka untuk berkembang di usus. Banyak makmal strain kehilangan kemampuan mereka untuk membentuk biofilm [70] [71] Ciri-ciri ini melindungi strain jenis liar dari antibodi dan serangan kimia lain,. Tetapi memerlukan perbelanjaan besar sumber daya tenaga dan material.

Pada tahun 1946, Joshua Lederberg dan Edward Tatum pertama menggambarkan fenomena yang dikenali sebagai konjugasi bakteria menggunakan E. coli sebagai bakteria model, [72] dan masih model utama untuk mempelajari konjugasi. [Rujukan?] E. coli merupakan bahagian integral dari percubaan pertama untuk memahami genetik fag, [73] dan penyelidik awal, seperti Seymour Benzer, digunakan E. coli dan fag T4 untuk memahami topografi struktur gen [74] Sebelum. untuk kajian Benzer, itu tidak diketahui apakah gen adalah struktur yang linier, atau jika memiliki pola percabangan.

E. coli adalah salah satu organisma pertama yang mengandungi genom yang diurutkan;. Genom lengkap E. coli K12 diterbitkan oleh Science pada tahun 1997 [75]

Percubaan evolusi jangka panjang menggunakan E. coli, bermula oleh Richard Lenski pada tahun 1988, telah membolehkan pemerhatian langsung dari perubahan evolusi besar dalam makmal [76] Dalam kajian ini,. Satu penduduk E. coli tak terduga mengembangkan kemampuan untuk aerobik memetabolisme sitrat. Kapasiti ini sangat jarang berlaku di E. coli. Sebagai ketidakupayaan untuk menumbuhkan aerobik biasanya digunakan sebagai kriteria diagnostik yang boleh digunakan untuk membezakan dari yang lain E. coli, bakteria erat berkaitan seperti Salmonella, inovasi ini mungkin menandakan peristiwa spesiasi diamati di makmal.

Dengan menggabungkan teknologi nano dengan pemandangan habitat ekologi lanskap kompleks dapat dihasilkan dengan butiran pada skala nano. [77] Pada ekosistem sintetik seperti eksperimen evolusi dengan E. coli telah dilakukan dalam rangka untuk mempelajari biofizikal istimewa yang diadaptasi dalam biogeografi pulau on-cip.


Rujukan[sunting | sunting sumber]

  1. "Escherichia coli O157:H7". CDC Division of Bacterial and Mycotic Diseases. http://www.cdc.gov/nczved/divisions/dfbmd/diseases/ecoli_o157h7/. Capaian 2011-04-19. 
  2. Vogt RL, Dippold L (2005). "Escherichia coli O157:H7 outbreak associated with consumption of ground beef, Jun–Julai 2002". Public Health Rep 120 (2): 174–8. PMC 1497708. PMID 15842119. //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1497708/. 
  3. Bentley R, Meganathan R (1 September 1982). "Biosynthesis of vitamin K (menaquinone) in bacteria". Microbiol. Rev. 46 (3): 241–80. PMC 281544. PMID 6127606. http://mmbr.asm.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=6127606. 
  4. 4.0 4.1 Hudault S, Guignot J, Servin AL (Julai 2001). "Escherichia coli strains colonising the gastrointestinal tract protect germfree mice against Salmonella typhimurium infection". Gut 49 (1): 47–55. doi:10.1136/gut.49.1.47. PMC 1728375. PMID 11413110. //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1728375/. 
  5. Reid G, Howard J, Gan BS (September 2001). "Can bacterial interference prevent infection?". Trends Microbiol. 9 (9): 424–8. doi:10.1016/S0966-842X(01)02132-1. PMID 11553454. 
  6. 6.0 6.1 6.2 Feng P, Weagant S, Grant, M (2002-09-01). "Enumeration of Escherichia coli and the Coliform Bacteria". Bacteriological Analytical Manual (8th ed.). FDA/Center for Food Safety & Applied Nutrition. http://www.cfsan.fda.gov/~ebam/bam-4.html. Capaian 2007-01-25. 
  7. 7.0 7.1 Thompson, Andrea. "E. coli Thrives in Beach Sands", Live Science, 2007-06-04. Dicapai pada 2007-12-03. 
  8. "Escherichia". Taxonomy Browser. NCBI. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=561&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock. Capaian 2007-11-30. 
  9. "Escherichia". Taxonomy Browser. NCBI. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=561&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock. Capaian 2007-11-30. 
  10. [1]
  11. Kubitschek HE (1 January 1990). "Cell volume increase in Escherichia coli after shifts to richer media". J. Bacteriol. 172 (1): 94–101. PMC 208405. PMID 2403552. http://jb.asm.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=2403552. 
  12. Madigan MT, Martinko JM (2006). Brock Biology of microorganisms (edisi 11th). Pearson. ISBN 0-13-196893-9. 
  13. Fotadar U, Zaveloff P, Terracio L (2005). "Growth of Escherichia coli at elevated temperatures". J. Basic Microbiol. 45 (5): 403–4. doi:10.1002/jobm.200410542. PMID 16187264. 
  14. Ingledew WJ, Poole RK (1984). "The respiratory chains of Escherichia coli". Microbiol. Rev. 48 (3): 222–71. PMC 373010. PMID 6387427. //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC373010/. 
  15. Darnton, N. C.; Turner, L.; Rojevsky, S.; Berg, H. C.. "On torque and tumbling in swimming Escherichia coli". J Bacteriol. 189 (5): 1756–1764. doi:10.1128/JB.01501-06. PMC 1855780. //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1855780/. 
  16. Brüssow H, Canchaya C, Hardt WD (September 2004). "Phages and the evolution of bacterial pathogens: from genomic rearrangements to lysogenic conversion". Microbiol. Mol. Biol. Rev. 68 (3): 560–602. doi:10.1128/MMBR.68.3.560-602.2004. PMC 515249. PMID 15353570. http://mmbr.asm.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15353570. 
  17. 17.0 17.1 Lukjancenko, O.; Wassenaar, T.M.; Ussery, D.W. (2010). "Comparison of 61 sequenced Escherichia coli genomes". Microb Ecol. 60 (4): 708–720. doi:10.1007/s00248-010-9717-3. PMC 2974192. PMID 20623278. //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2974192/. 
  18. Krieg, N. R.; Holt, J. G., eds (1984). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 1 (edisi First). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. m/s. 408–420. ISBN 0683041088. 
  19. Lan, R.; Reeves, P.R. (2002). "Escherichia coli in disguise: molecular origins of Shigella". Microbes Infect. 4 (11): 1125–1132. doi:10.1016/S1286-4579(02)01637-4. PMID 12361912. 
  20. Orskov, I.; Orskov, F.; Jann, B.; Jann, K. (1977). "Serology, chemistry, and genetics of O and K antigens of Escherichia coli". Bacteriol Rev. 41 (3): 667–710. PMC 414020. PMID 334154. //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC414020/. 
  21. Lawrence, J. G.; Ochman, H. (1998). "Molecular archaeology of the Escherichia coli genome". PNAS 95 (16): 9413–9417. doi:10.1073/pnas.95.16.9413. JSTOR 45488. PMC 21352. //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC21352/. 
  22. 22.0 22.1 Nataro JP, Kaper JB (January 1998). "Diarrheagenic Escherichia coli". Clin. Microbiol. Rev. 11 (1): 142–201. PMC 121379. PMID 9457432. //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC121379/. 
  23. "Escherichia". bacterio.cict.fr. http://www.bacterio.cict.fr/e/escherichia.html. 
  24. "Escherichia coli (Migula 1895) Castellani and Chalmers 1919". JCM Catalogue. http://www.jcm.riken.go.jp/cgi-bin/jcm/jcm_number?JCM=1649. 
  25. 25.0 25.1 Todar, K.. "Pathogenic E. coli". Online Textbook of Bacteriology. University of Wisconsin–Madison Department of Bacteriology. http://www.textbookofbacteriology.net/e.coli.html. Capaian 2007-11-30. 
  26. World Health Organization. Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC).
  27. Rendón, M. A.; et al. (2007). "Commensal and pathogenic Escherichia coliuse a common pilus adherence factor for epithelial cell colonization". PNAS 104 (25): 10637–42. doi:10.1073/pnas.0704104104. PMC 1890562. PMID 17563352. //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1890562/. 
  28. Harrison, Tinsley Randolph; Maxwell Myer Wintrobe (2005). Harrison's principles of internal medicine, Volumen 1. McGraw-Hill. ISBN 007139141X. 
  29. Nicolle LE (February 2008). "Uncomplicated urinary tract infection in adults including uncomplicated pyelonephritis". Urol. Clin. North Am. 35 (1): 1–12, v. doi:10.1016/j.ucl.2007.09.004. PMID 18061019. 

Pautan luar[sunting | sunting sumber]