Guanosina difosfat

Guanosina difosfat
Pengecam
No. Pendaftaran CAS	146-91-8 ;
Imej model 3D Jmol	Imej berinteraktif;
ChEBI	CHEBI:17552 ;
ChEMBL	ChEMBL384759 ;
ChemSpider	8630 ;
IUPHAR/BPS	2410;
PubChem CID	730;
UNII	HLJ737P865 ;
CompTox Dashboard (EPA)	DTXSID90163254 ;
	InChI InChI=1S/C10H15N5O11P2/c11-10-13-7-4(8(18)14-10)12-2-15(7)9-6(17)5(16)3(25-9)1-24-28(22,23)26-27(19,20)21/h2-3,5-6,9,16-17H,1H2,(H,22,23)(H2,19,20,21)(H3,11,13,14,18)/t3-,5-,6-,9-/m1/s1 Key: QGWNDRXFNXRZMB-UUOKFMHZSA-N ;
	SMILES C1=NC2=C(N1C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)NC(=NC2=O)N;
Sifat
Formula kimia	C10H15N5O11P2
Jisim molar	443.200522
	Kecuali jika dinyatakan sebaliknya, data diberikan untuk bahan-bahan dalam keadaan piawainya (pada 25 °C [77 °F], 100 kPa).
	pengesahan (apa yang perlu: /?)
	Rujukan kotak info

Guanosina difosfat atau GDP ialah difosfat nukleosida. Ia merupakan ester asid pirofosforik dengan guanosin nukleosida. GDP terdiri daripada kumpulan pirofosfat, ribosa selaku gula pentosa, dan guanina nukleobes.^[1]

GDP ialah hasil penyahfosforisian GTP oleh GTPase seperti protein G yang terlibat dalam transduksi isyarat.

GDP ditukar kepada GTP dengan bantuan kinase piruvat dan fosfoenolpiruvat.

GDP dan GTP[sunting | sunting sumber]

Hidrolisis GTP kepada GDP[sunting | sunting sumber]

Hidrolisis GTP kepada GDP dibantu oleh enzim GTPase yang menggunakan motif tapak aktif terpelihara yang dikenali sebagai protein pengaktif GTPase (GAP). Pada mulanya, molekul air diselaraskan oleh sisa tapak aktif enzim GTPase. Molekul air menyerang γ-fosfat GTP yang membawa kepada pembentukan keadaan peralihan pentavalen. Keadaan peralihan ini distabilkan melalui interaksi dengan sisa tapak aktif, termasuk sisa pemangkin terpelihara. Akibatnya, γ-fosfat terbelah, dan fosfat tak organik (Pi) dibebaskan. Langkah ini juga menyebabkan perubahan konformasi dalam enzim yang menggalakkan pelepasan GDP.^[2]

Fungsi biokimia[sunting | sunting sumber]

Isyarat intrasel[sunting | sunting sumber]

GDP terlibat dalam proses isyarat intrasel yang berfungsi sebagai pengawal selia kritikal dalam aktiviti GTPase. GTPases bertindak sebagai suis molekul, dan berkitar antara keadaan terikat GTP aktif dan keadaan terikat GDP yang tidak aktif. Penukaran antara GDP dan GTP dikawal ketat dan berfungsi sebagai pemasa molekul dalam laluan transduksi isyarat. Apabila isyarat ekstraselular mencetuskan pengaktifan reseptor bergandingan protein G (GPCR), protein G yang berkaitan menukar GDP terikatnya bagi GTP, membawa kepada perubahan konformasi dan pengaktifan lata isyarat hiliran.^[3] Pengaktifan ini boleh merangsang pelbagai tindak balas sel, termasuk modulasi ekspresi gen, penyusunan semula sitoskeletal, dan pengawalan aktiviti enzim. Hidrolisis GTP kepada GDP oleh aktiviti GTPase bagi protein G memulihkan keadaan tidak aktif, dengan itu menamatkan pengisyaratan.^[4]

Rujukan[sunting | sunting sumber]

^ Crane, Laura J; Miller, David Lee (1974). "Guanosine triphosphate and guanosine diphosphate as conformation-determining molecules. Differential interaction of a fluorescent probe with the guanosine nucleotide complexes of bacterial elongation factor Tu". Biochemistry. 13 (5): 933–939. doi:10.1021/bi00702a017. PMID 4591619.
^ Calixto, Ana R.; Moreira, Cátia; Pabis, Anna; Kötting, Carsten; Gerwert, Klaus; Rudack, Till; Kamerlin, Shina C.L. (2019-07-10). "GTP Hydrolysis Without an Active Site Base: A Unifying Mechanism for Ras and Related GTPases". Journal of the American Chemical Society (dalam bahasa Inggeris). 141 (27): 10684–10701. doi:10.1021/jacs.9b03193. ISSN 0002-7863.
^ Downes, G. B.; Gautam, N. (1999-12-15). "The G protein subunit gene families". Genomics. 62 (3): 544–552. doi:10.1006/geno.1999.5992. ISSN 0888-7543. PMID 10644457.
^ Schmidt, Anja; Hall, Alan (2002-07-01). "Guanine nucleotide exchange factors for Rho GTPases: turning on the switch". Genes & Development (dalam bahasa Inggeris). 16 (13): 1587–1609. doi:10.1101/gad.1003302. ISSN 0890-9369. PMID 12101119.

[1] Crane, Laura J; Miller, David Lee (1974). "Guanosine triphosphate and guanosine diphosphate as conformation-determining molecules. Differential interaction of a fluorescent probe with the guanosine nucleotide complexes of bacterial elongation factor Tu". Biochemistry. 13 (5): 933–939. doi:10.1021/bi00702a017. PMID 4591619.

[2] Calixto, Ana R.; Moreira, Cátia; Pabis, Anna; Kötting, Carsten; Gerwert, Klaus; Rudack, Till; Kamerlin, Shina C.L. (2019-07-10). "GTP Hydrolysis Without an Active Site Base: A Unifying Mechanism for Ras and Related GTPases". Journal of the American Chemical Society (dalam bahasa Inggeris). 141 (27): 10684–10701. doi:10.1021/jacs.9b03193. ISSN 0002-7863.

[3] Downes, G. B.; Gautam, N. (1999-12-15). "The G protein subunit gene families". Genomics. 62 (3): 544–552. doi:10.1006/geno.1999.5992. ISSN 0888-7543. PMID 10644457.

[4] Schmidt, Anja; Hall, Alan (2002-07-01). "Guanine nucleotide exchange factors for Rho GTPases: turning on the switch". Genes & Development (dalam bahasa Inggeris). 16 (13): 1587–1609. doi:10.1101/gad.1003302. ISSN 0890-9369. PMID 12101119.

[1]

[2]

[3]

[4]